Nejvyšší kontrolní úřad prověřil, jestli Ministerstvo financí (MF) postupovalo při vedení účetnictví v roce 2013 v souladu s příslušnými právními předpisy. Kontrola se zaměřila nejen na významné účetní případy samotného ministerstva, ale i dalších rozpočtových kapitol, o kterých MF účtuje ve svém účetnictví. Konkrétně šlo o rozpočtové kapitoly Státní dluh, Operace státních finančních aktiv a Všeobecná pokladní správa. Byla objevena řada nedostatků.
Kontrola účetnictví MF byla svým rozsahem i zaměřením mimořádná, protože MF je z pohledu zobrazovaných údajů nejvýznamnější účetní jednotkou státu. Jeho účetnictví slouží jako zdroj informací nejen při sestavování státního závěrečného účtu, ale údaje z něj využívá i Český statistický úřad při zpracovávání vládních statistik.
V účetnictví MF byly NKÚ zjištěny některé systémové nedostatky, například nesprávné účtování o operacích s dočasně volnými prostředky státní pokladny nebo nesprávné účtování o závazcích ze sdílených daní. MF také účtovalo o pojistném na veřejné zdravotní pojištění osob, u kterých je plátcem pojistného stát, jako o nákladech z činnosti, přestože se jedná o transfer prostředků zdravotním pojišťovnám.
NKÚ upozornil, že MF neúčtovalo o významném snížení hodnoty majetkových účastí státu v obchodních společnostech, které byly v konkurzu nebo v likvidaci, či nesprávně účtovalo kurzové rozdíly v případě majetkových účastí, jež mají být oceňovány reálnou hodnotou. Nesprávně také ocenilo dlouhodobé podmíněné závazky související s odstraňováním ekologických škod vzniklých před privatizací majetku státu nebo vykázalo závazky Fondu privatizace jako krátkodobé, tedy splatné do jednoho roku, přestože se jedná o závazky dlouhodobé.
NKÚ konstatoval, že některá ustanovení právních předpisů nejsou v případě účetnictví MF jednoznačně aplikovatelná. Jiná ustanovení právních předpisů mají zase za následek, že účetnictví MF obsahuje informace odlišné od toho, co uživatelé údajů z jeho účetnictví běžně očekávají. Proto NKÚ doporučuje, aby MF jakožto resort, který zodpovídá za pravidla účetnictví, tyto nejednoznačné účetní předpisy upravilo.
